Les yeux sont des organes du système visuel. Ils fournissent la vision des organismes, la capacité de traiter les détails visuels, ainsi que plusieurs fonctions de réponse photo indépendantes de la vision. Les yeux détectent la lumière et la convertissent en impulsions électrochimiques dans les neurones. Dans les organismes supérieurs, l'œil est un système optique complexe qui recueille la lumière de l'environnement environnant, régule son intensité à travers un diaphragme, la focalise à travers un assemblage réglable de lentilles pour former une image, convertit cette image en un ensemble de signaux électriques, et transmet ces signaux au cerveau par des voies neuronales complexes qui relient l'œil via le nerf optique au cortex visuel et à d'autres zones du cerveau. Les yeux dotés d'un pouvoir de résolution se présentent sous dix formes fondamentalement différentes, et 96% des espèces animales possèdent un système optique complexe. Des yeux à résolution d'image sont présents chez les mollusques, les cordés et les arthropodes.

Les «yeux» les plus simples, comme ceux des microorganismes, ne font que détecter si l'environnement est clair ou sombre, ce qui est suffisant pour entraîner les rythmes circadiens. À partir d'yeux plus complexes, les cellules ganglionnaires photosensibles rétiniennes envoient des signaux le long du tractus rétinohypothalamique aux noyaux suprachiasmatiques pour effectuer un ajustement circadien et à la zone prétectale pour contrôler le réflexe pupillaire lumineux.

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