バクテリアの一般名詞バクテリア、単数バクテリア）は原核微生物の大きなドメインを構成します。通常、バクテリアは数マイクロメートルの長さで、球形から棒状、らせん状まで、さまざまな形をしています。バクテリアは地球上で最初に出現した生命体の1つであり、その生息地のほとんどに存在しています。細菌は、土壌、水、酸性温泉、放射性廃棄物、および地殻の深い部分に生息しています。細菌はまた、植物や動物と共生および寄生関係にあります。ほとんどの細菌は特徴付けられておらず、細菌門の約半分のみが実験室で増殖できる種を持っています。細菌の研究は、微生物学の一分野である細菌学として知られています。

土壌1グラムには通常4000万個の細菌細胞があり、ミリリットルの淡水には100万個の細菌細胞があります。地球上には約5〜1030のバクテリアがあり[5]、すべての植物や動物のバイオマスを超えるバイオマスを形成しています。細菌は、大気からの窒素の固定などの栄養素をリサイクルすることにより、栄養素サイクルの多くの段階で不可欠です。栄養サイクルには死体の分解が含まれ、細菌はこのプロセスの腐敗段階の原因です。熱水噴出孔とコールドシープを取り巻く生物学的コミュニティでは、極限細菌が、硫化水素やメタンなどの溶解した化合物をエネルギーに変換することにより、生命を維持するために必要な栄養素を提供します。 2013年3月に、2012年10月に研究者によって報告されたデータが公開されました。バクテリアはマリアナ海溝で繁殖することが示唆されました。マリアナ海溝は、深さ11キロまでで、海で知られている最も深い部分です。他の研究者は、微生物が米国北西部の沿岸沖の2.6キロメートルの海の下で海底下の最大580メートルの岩の内部で繁殖するという関連した研究を報告しました。研究者の一人によれば、「微生物はどこにでも見つけることができます。それらは条件に非常に順応性があり、どこにいても生き残ることができます。」

人体のバクテリア細胞が人間の細胞数を10：1で上回るという有名な概念は裏付けられています。人間の微生物叢には約39兆の細菌細胞があり、「参照」70 kgの男性の身長は170 cmですが、体内には30兆の人間の細胞があります。つまり、実際の数では優位にありますが、それは30％であり、900％ではありません。

最大数は腸内細菌叢に存在し、皮膚に多数存在します。体内の細菌の大部分は免疫系の保護作用によって無害にされますが、多くは特に腸内細菌叢に有益です。しかし、細菌のいくつかの種は病原性であり、コレラ、梅毒、炭疽菌、ハンセン病、腺ペストを含む感染症を引き起こします。最も一般的な致命的な細菌性疾患は呼吸器感染症であり、結核だけで年間約200万人が死亡しており、そのほとんどがサハラ以南のアフリカです。先進国では、抗生物質は細菌感染症の治療に使用されており、農業にも使用されており、抗生物質耐性がますます問題になっています。業界では、細菌は下水処理と油流出の内訳、発酵によるチーズとヨーグルトの生産、鉱業部門での金、パラジウム、銅、その他の金属の回収、ならびにバイオテクノロジー、および製造において重要です抗生物質およびその他の化学物質の。