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Los calamares son cefalópodos de los dos órdenes Myopsida y Oegopsida, que anteriormente se consideraban dos subórdenes del orden Teuthida, sin embargo, investigaciones recientes muestran que Teuthida es parafilético. Los dos pedidos actuales comprenden alrededor de 304 especies. Como todos los demás cefalópodos, los calamares tienen una cabeza distinta, simetría bilateral, un manto y brazos. Los calamares, como las sepias, tienen ocho brazos dispuestos en pares y dos tentáculos, generalmente más largos.
Los calamares son miembros de la clase Cephalopoda, la subclase Coleoidea, las dos órdenes, Myopsida y Oegopsida (incluidos los calamares gigantes como Architeuthis dux). Un Teuthida válido habría sido el mayor pedido de cefalópodos con alrededor de 300 especies clasificadas en 29 familias.
Las órdenes Myopsida y Oegopsida se clasifican en el superorden Decapodiformes (del griego para "diez patas"). Otros dos órdenes de cefalópodos decapodiformes también se llaman calamares, aunque son taxonómicamente distintos de los calamares y difieren notablemente en sus características anatómicas groseras. Son el calamar bobtail de orden Sepiolida y el calamar de cuerno de carnero del orden monotípico Spirulida. Sin embargo, el calamar vampiro está más relacionado con los pulpos que con cualquier calamar.
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