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Augen sind Organe des visuellen Systems. Sie bieten Organismen Sicht, die Fähigkeit, visuelle Details zu verarbeiten, und ermöglichen mehrere Fotoantwortfunktionen, die unabhängig von der Sicht sind. Augen erkennen Licht und wandeln es in Neuronen in elektrochemische Impulse um. In höheren Organismen ist das Auge ein komplexes optisches System, das Licht aus der Umgebung sammelt, seine Intensität durch ein Diaphragma reguliert, es durch eine einstellbare Anordnung von Linsen fokussiert, um ein Bild zu erzeugen, dieses Bild in einen Satz elektrischer Signale umwandelt und überträgt diese Signale über komplexe Nervenbahnen, die das Auge über den Sehnerv mit dem visuellen Kortex und anderen Bereichen des Gehirns verbinden, an das Gehirn. Augen mit Auflösungsvermögen haben zehn grundlegend unterschiedliche Formen, und 96% der Tierarten besitzen ein komplexes optisches System. Bildauflösende Augen sind in Weichtieren, Akkordaten und Arthropoden vorhanden.

Die einfachsten "Augen", wie die in Mikroorganismen, erkennen lediglich, ob die Umgebung hell oder dunkel ist, was für die Mitnahme von zirkadianen Rhythmen ausreicht. Von komplexeren Augen senden lichtempfindliche Ganglienzellen der Netzhaut Signale entlang des retinohypothalamischen Trakts an die suprachiasmatischen Kerne, um eine zirkadiane Anpassung zu bewirken, und an den pretektalen Bereich, um den Lichtreflex der Pupille zu steuern.

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